Winmostar/MOPAC掲示板

Re:Re:Jmolのパス設定について

投稿日 12月17日(木)17時37分 投稿者 みき 削除

お忙しいところ、迅速に対応して頂きありがとうございました。
Winmostarで軌道が表示できるので、あまり必要性はないかも
しれませんね。
私も、久しぶりに（なんとなく）Jmolを設定しようとして気が
つきましたので、お時間、お手間をとらせて恐縮しております。
今後ともよろしくお願いします。

Re:Jmolのパス設定について

投稿日 12月17日(木)17時26分 投稿者 千田 削除

Jmolのパスの設定ができなくなっていました。
MO表示機能の改善等で、Jmolが必要なくなっていたので、
気がつきませんでした。
修正しましたので、バージョンアップをお願いいたします。

以前のバージョンのWinmostarのMO表示では、いろいろ制限が
あったので、無理やりですがJmolに渡す機能をつけていました。
もうJmolは必要ないと思うので削除することも考えていましたが、
まだJmolでないといけないところはあるでしょうか？

Jmolのパス設定について

投稿日 12月17日(木)16時47分 投稿者 みき 削除

いつも利用させて頂いています。
お尋ねしたいのですが、最新のWinmostarからJmolが動きません。Jmol単体
(\jmol-11.8.13\jmol.jar)で起動できることは確認しています。
Winmostar V3.802qの「パスの設定」から、\jmol-11.8.13\jmol.batを指定し、
OKを押して、設定しますが、再び、「パスの設定」をみると「c:\jmol-11.5」
に戻っており、パスの設定ができていないと思います。
こちらの操作、設定ミスでしょうか？

Re:スケールについて

投稿日 12月10日(木)14時09分 投稿者 学生 削除

回答ありがとうございます。

Re:NOMM, MMOKについて

投稿日 12月8日(火)15時58分 投稿者 千田 削除

計算→MOPACｷｰﾜｰﾄﾞ→SetupのMMのところで指定できます。

NOMM, MMOKについて

投稿日 12月8日(火)13時38分 投稿者 YJ 削除

初めて使用させていただきました。
アミノ結合をもつ分子を入力し、計算を実行したところ、
計算の出力ファイルの最後に
以下のメッセージが出ました。

THIS SYSTEM CONTAINS -HNCO- GROUPS.
YOU MUST SPECIFY "NOMM" OR "MMOK" REGARDING MOLECULAR MECHANICS CORRECTION

このNOMM, MMOKはどのように指定すればよろしいのでしょうか。
よろしくお願いします。

スケールについて

投稿日 12月7日(月)20時01分 投稿者 千田 削除

> 構造式からスケールを測る
どのようなことを指すのか良くわかりませんが、
原子間距離、角度、二面角は常に画面上部に表示されていますので、原子
をクリックして確認してください。

表示→表示選択→メッシュで、メッシュ状のスケールを表示することもできます。

その他→分子体積・表面積、アスペクト比で、分子長等を求めることもできます。

スケールについて

投稿日 12月7日(月)17時19分 投稿者 学生 削除

はじめまして。
このソフトでは構造式からスケールを測ることは可能でしょうか。

Re:Re:番号交換について

投稿日 11月1日(日)16時26分 投稿者 yy 削除

すいません。こちらの操作ミスでした。解決しました

Re:番号交換について

投稿日 10月30日(金)21時20分 投稿者 千田 削除

構造が変わるというのはバグと思われますが、こちらでは再現できません。
実際に使用したデータを添付して、何番の原子の交換で構造が変わるのかを
教えて頂ければ、最優先で修正いたします。

結合情報が変わるだけで構造に変化がないのは、バグではなくて仕様です。

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