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テーマ | ページ | 演習のポイント |
カフェインのモデリング | caffeine_model.html | [Rep]または右クリックで部品置換 [-C5H4]、環構築、クリーンでインデニル環 [Chng]で元素変更 |
部品登録 | caffeine_parts.html | 部品登録機能 |
2分子編集 |
2mol1.html 2mol2.html |
1分子を2分子に分割 Winmostarを2重起動して結合 |
スチレンのMOPAC計算とMO表示 | styrene_mo.html | 計算/MOP6W70でMOPAC6の計算 *.mgfを読んで、エネルギー順位とMO表示 |
MOPACによる水の振動解析 | h2o_force.html | 構造最適化した後、Forceで計算 |
WinGAMESSによる水の最適化と振動解析 | h2o_gamess_opt.html h2o_gamess_hes.html |
RUNTYP=OPTIMIZEで構造最適化 RUNTYP=HESSIANで振動解析 |
ヘキサヘリセン | hexahelicene_model.html | 環構築とクリーン |
アセトンの紫外・可視吸収スペクトル | acetone.html | MOPACで構造最適化後に、CNDO/S計算 |
C60のモデリング | c60_model1.html c60_model2.html c60_metal.html |
部品は[-C5H4]のみ 水素削除、結合付加、クリーン 一回だけ原子移動 金属は外に置いてから、内側に移動 |
分子動力学法のアニメーション | md_sample.gld md_sample.html |
MDの計算結果のアニメーション表示もできます。 md_sample.gldのフォーマットを参考にしてください。右クリックでダウンロードできます。拡張子はgldにしてください。 原子番号112は、セル表示用のダミー原子です。 |