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テーマ ページ 演習のポイント
カフェインのモデリング caffeine_model.html [Rep]または右クリックで部品置換
[-C5H4]、環構築、クリーンでインデニル環
[Chng]で元素変更
部品登録 caffeine_parts.html 部品登録機能
2分子編集 2mol1.html
2mol2.html
1分子を2分子に分割
Winmostarを2重起動して結合
スチレンのMOPAC計算とMO表示 styrene_mo.html 計算/MOP6W70でMOPAC6の計算
*.mgfを読んで、エネルギー順位とMO表示
MOPACによる水の振動解析 h2o_force.html 構造最適化した後、Forceで計算
WinGAMESSによる水の最適化と振動解析 h2o_gamess_opt.html
h2o_gamess_hes.html
RUNTYP=OPTIMIZEで構造最適化
RUNTYP=HESSIANで振動解析
ヘキサヘリセン hexahelicene_model.html 環構築とクリーン
アセトンの紫外・可視吸収スペクトル acetone.html MOPACで構造最適化後に、CNDO/S計算
C60のモデリング c60_model1.html
c60_model2.html
c60_metal.html
部品は[-C5H4]のみ
水素削除、結合付加、クリーン
一回だけ原子移動
金属は外に置いてから、内側に移動
分子動力学法のアニメーション md_sample.gld
md_sample.html
MDの計算結果のアニメーション表示もできます。
md_sample.gldのフォーマットを参考にしてください。右クリックでダウンロードできます。拡張子はgldにしてください。
原子番号112は、セル表示用のダミー原子です。