6.15. メニュー¶
あらかじめ用意された二つのシミュレーションセルのファイル（mol2またはcif形式）を接合して界面モデルを作成します。
- Cell Files
接合させる2つのセル（Cell 1および2）の情報を指定します。各項目を設定後[Next]ボタンをクリックします。
- Cell 1およびCell 2
- [Browse]
- 接合させるファイル（mol2またはcif形式）を指定します。ファイルをドラッグアンドドロップして指定することも可能です。
- [Lattice Constants]
- [a],[b],[c],[Alpha],[Beta],[Gamma]
- セル定数が表示されます。
- Direction
セルを接合させる方向およびセル間の間隔を指定します。各項目を設定後[Next]ボタンをクリックします。
- Direction
- [a-axis]
- a軸方向に沿って２つのセルを結合します。
- [b-axis]
- b軸方向に沿って２つのセルを結合します。
- [c-axis]
- c軸方向に沿って２つのセルを結合します。
- Order
- [Normal]
- Cell 1にCell 2を重ねます。
- [Reverse]
- Cell 2にCell 1を重ねます。
- [Interval]
- セル間の間隔を指定します。2面間の距離ではなく、軸に沿った長さとなります。
- [Scaling cells to average size]
- セルの大きさに違いがある場合、平均サイズに伸縮します。
- [Padding small cell to the size of large cell]
- セルの大きさに違いがある場合、小さい方のセルに真空を入れて、大きい方のセルに合わせます。
- Repeat
各セルのリピート数を指定します。最後に[Build]ボタンをクリックします。
- Number of Cell 1およびCell 2
- [a-axis]
- セル1またはセル2のa軸方向のリポート数を指定します。
- [b-axis]
- セル1またはセル2のb軸方向のリピート数を指定します。
- [c-axis]
- セル1またはセル2のc軸方向のリピート数を指定します。
- [Suggest]
- Cell 1とCell 2のサイズが近くなるようなリピート数の組み合わせを提示します。 Ratioが1に近い組み合わせほど両セルの歪みが少なくなります。 列をクリックしてSetボタンを押すか、ダブルクリックすると反映されます。
- Lattice Constrants
- [a],[b],[c],[Alpha],[Beta],[Gamma]
- 接合後のセルの格子定数が表示されます。
- [Build]
- 接合したセルを保存します。系のサイズが大きいと処理時間が長くなる場合があります。