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チュートリアル

分子モデリング

キーワード 更新日 備考
有機分子 ベンゼン, イソオクタン, フルオレン, カフェイン, 尿酸 2022年4月27日 動画あり(V10)
超分子 ベンゼン, 2量体 UPDATED 2022年10月7日 -
金属錯体 Ferrocene, Zn[saloph], Ru[Tris(2,2'-bipyridyl)] UPDATED 2022年10月7日 -
配向・原点の調整 イソオクタン, グループを回転(配向を指定), 選択原子の位置を原点に設定 UPDATED 2022年10月7日 -

結晶モデリング

キーワード 更新日 備考
単位結晶 アナターゼ型TiO2結晶, スーパーセル UPDATED 2022年10月7日 -
スラブモデル ルチル型TiO2 (1 1 0)面, 上下対称 (表面切り出し、真空層を挿入チュートリアルを統合) UPDATED 2022年11月1日 エコノミー・
学生版非対応
分子吸着モデル FCC Pt (1 1 1)面, CO, ontop, bridge, hollow (hcp, fcc) NEW 2022年12月8日 エコノミー・
学生版非対応

リモートジョブ

キーワード 更新日 備考
プロジェクトモード向け NEW 2022年8月8日 エコノミー・
学生版非対応
ファイルモード向け - - エコノミー・
学生版非対応

MOPAC

キーワード 更新日 備考
基礎編 プロピレン分子, 構造最適化, IR, 分子軌道, Mulliken電荷, HOMO-LUMOエネルギー, イオン化ポテンシャル, 生成熱, ゼロ点エネルギー UPDATED 2022年10月1日 -
遷移状態・IRC計算 ブロモエタン, 塩化物イオン, 化学反応解析, SN2反応, 気相反応, Minimum Energy Path, Intrinsic Reaction Coordinate, 遷移状態構造最適化 UPDATED 2022年10月1日 エコノミー・
学生版非対応
二面角スキャン ブタン, エネルギー曲面 UPDATED 2022年10月1日 -
生成熱・活性化エネルギー ブタジエン, エチレン, Diels-Alder反応, 生成熱, 活性化エネルギー, 気相反応, 遷移状態構造最適化 UPDATED 2022年10月1日 -

CNDO/S

キーワード 更新日 備考
基礎編 インディゴ分子, SMILES入力, UV-Visスペクトル UPDATED 2022年10月1日 -

GAMESS

キーワード 更新日 備考
基礎編 プロピレン分子, 構造最適化, IR, ラマン, NMR, UV-Vis, 分子軌道, 静電ポテンシャル, HOMO-LUMOエネルギー、イオン化ポテンシャル 2022年4月29日 動画あり(V10)
蛍光スペクトル計算 フルオレン, 蛍光スペクトル, 励起状態構造最適化 2022年4月21日 -
溶媒効果 アセトン, 水溶液, 構造最適化, IR 2022年4月21日 -
生成熱・活性化エネルギー ブロモエタン, 塩化物イオン, SN2反応, ブタジエン, エチレン, Diels-Alder反応, 生成熱, 活性化エネルギー, 気相反応, DMSO溶液中反応, 溶媒効果, 遷移状態構造最適化 2022年4月22日 -
2量体計算(分散力補正) ベンゼン2量体, 分散力補正, π-π相互作用, B3LYP-D3 2022年4月22日 -
複数分子構造に対する自動計算 SDFファイル, ハイスループット計算, コンビナトリアル化学, バーチャルスクリーニング, パラメータ・構造スキャンアドオン NEW 2023年1月10日 アドオンが必要

Gaussian

キーワード 更新日 備考
基礎編 プロピレン分子, 構造最適化, IR, ラマン, NMR, UV-Vis, 分子軌道, 静電ポテンシャル, HOMO-LUMOエネルギー、イオン化ポテンシャル UPDATED 2022年12月7日 エコノミー・
学生版非対応
遷移状態・IRC計算 ブロモエタン, 塩化物イオン, 化学反応解析, SN2反応, 気相反応, Minimum Energy Path, Intrinsic Reaction Coordinate, 遷移状態構造最適化 UPDATED 2023年1月12日 エコノミー・
学生版非対応
蛍光・りん光スペクトル計算 フルオレン, 蛍光スペクトル, りん光スペクトル, 励起状態構造最適化 UPDATED 2023年1月12日 エコノミー・
学生版非対応
溶媒効果 アセトン, 水溶液, 構造最適化, IR UPDATED 2023年1月17日 エコノミー・
学生版非対応
2量体計算(分散力補正) ベンゼン2量体, 分散力補正, π-π相互作用, B3LYP-D3 UPDATED 2022年12月12日 エコノミー・
学生版非対応
NBO電荷 エタノール, Natural Bond Orbital(NBO)電荷, Natural Population Analysis(NPA)電荷, Mulliken電荷 UPDATED 2022年12月12日 エコノミー・
学生版非対応
元素ごとの基底関数・ECP指定 ブロモクロロメタン, 基底関数, ECP, Basis Set Exchange UPDATED 2022年12月12日 エコノミー・
学生版非対応
複数分子構造に対する自動計算 SDFファイル, ハイスループット計算, コンビナトリアル化学, バーチャルスクリーニング, パラメータ・構造スキャンアドオン NEW 2023年1月10日 アドオンが必要

NWChem

キーワード 更新日 備考
基礎編 プロピレン分子, 構造最適化, IR, ラマン, NMR, UV-Vis, 分子軌道, 静電ポテンシャル, HOMO-LUMOエネルギー、イオン化ポテンシャル 2022年4月22日 V10
NEB法 クロロエタン, 化学反応解析, SN2反応, 気相反応, Nudged Elastic Band, 遷移状態探索 2020年3月2日 V10
2量体計算(分散力補正) ベンゼン2量体, 分散力補正, π-π相互作用, B3LYP-D3 2020年5月20日 V10

LAMMPS

キーワード 更新日 備考
シミュレーションセルの作成 - - -
力場の自動編集 OPLS-AA、LiPF6-、固体壁、力場の補完、平衡長・平衡角の調整、力場拡張アドオン NEW 2022年10月1日 アドオンが必要
基礎編 テトラヒドロフラン, 液体, AM1-BCC電荷, GAFF, 熱力学量, アニメーション, 動径分布関数, 平均二乗変位, 自己拡散係数, 比熱 2022年4月27日 -
固体壁を含む系 グラフェン, 水, 界面ビルダ, 不均一核生成, 固液界面系, 固体壁の固定, 吸着 2022年5月9日 エコノミー・
学生版非対応
蒸気圧・表面張力 水, 気液界面, 相平衡, 表面張力, 蒸気圧, 密度分布, 気液平衡密度 NEW 2022年10月1日 -
界面張力 水, ベンゼン, 液液界面, 界面張力, 相平衡, 密度分布, 界面ビルダ, 平衡密度 NEW 2022年10月1日 -
熱伝導率・粘度・誘電率 水, 液体, 温度・密度の自動スケーリング, 自己相関関数, Green-Kubo式, 緩和弾性率 UPDATED 2022年10月11日 エコノミー・
学生版非対応
電解液系 炭酸プロピレン, リチウムイオン, LiBF4, RESP電荷, 多成分系, 自己拡散係数 UPDATED 2022年10月1日 -
融点計算 シリコン, 界面ビルダ, Tersoff, 固液界面系, 相平衡, NPH一定計算 2022年5月10日 -
ガラス転移温度(ポリマー, スキャン計算) ポリプロピレン, Dreiding, ポリマーメルト, ポリマービルダ, 比体積, Tg, パラメータ・構造スキャンアドオン NEW 2022年10月3日 アドオンが必要
エコノミー・
学生版非対応
ガラス転移温度(ポリマー, 冷却計算) ポリプロピレン, Dreiding, ポリマーメルト, ポリマービルダ, 比体積, Tg, アニーリング 2022年4月28日 エコノミー・
学生版非対応
伸長計算(ポリマー) ポリエチレン, Dreiding, ポリマーメルト, ポリマービルダ, 破壊, ひずみ-応力曲線, SS曲線 2022年4月28日 エコノミー・
学生版非対応
線膨張率(固体) シリコン, 結晶ビルダ, Tersoff, アニーリング計算, 線膨張率 2022年5月10日 エコノミー・
学生版非対応
伸長計算(固体) アルミ, 結晶ビルダ, EAM, スーパーセル, 欠陥, ひずみ-応力曲線, SS曲線 2022年5月10日 エコノミー・
学生版非対応
散逸粒子動力学 ジブロックコポリマー, DPD, モルフォロジ, 散乱関数, ラメラ構造 2022年8月2日 エコノミー・
学生版非対応

Gromacs

キーワード 更新日 備考
シミュレーションセルの作成 - - -
力場の自動編集 OPLS-AA、LiPF6-、固体壁、力場の補完、平衡長・平衡角の調整、力場拡張アドオン NEW 2022年10月1日 アドオンが必要
基礎編 テトラヒドロフラン, 液体, AM1-BCC電荷, GAFF, 熱力学量, アニメーション, 動径分布関数, 平均二乗変位, 自己拡散係数, 比熱 UPDATED 2022年10月1日 動画あり(V10)
タンパク系 リゾチーム, PDB, 水素付加, 溶媒配置, イオン追加, 分子の固定, RMSD UPDATED 2022年10月11日 -
蒸気圧・表面張力 水, 気液界面, 相平衡, 表面張力, 蒸気圧, 密度分布, 気液平衡密度 UPDATED 2022年10月1日 -
界面張力 水, ベンゼン, 液液界面, 界面張力, 相平衡, 密度分布, 界面ビルダ, 平衡密度 UPDATED 2022年10月1日 -
誘電率・粘度 水, 液体, 温度・密度の自動スケーリング UPDATED 2022年10月11日 エコノミー・
学生版非対応
電解液系 炭酸プロピレン, リチウムイオン, LiBF4, RESP電荷, 多成分系, 自己拡散係数 NEW 2022年10月1日 エコノミー・
学生版非対応
溶解度/χ/DPDパラメータ 水, ベンゼン, Hildebrandの溶解度パラメータ, SP値, χパラメータ, DPD aijパラメータ, 凝集エネルギー, 蒸発熱 UPDATED 2022年10月11日 エコノミー・
学生版非対応
溶媒和自由エネルギー(ER法) エタノール, 水, 水和自由エネルギー, 希釈溶液, エネルギー表示法, ERmod UPDATED 2022年10月11日 エコノミー・
学生版非対応
溶媒和自由エネルギー(BAR法) エタノール, 水, 水和自由エネルギー, 希釈溶液, Bennett Acceptance Ratio法 2020年3月2日 エコノミー・
学生版非対応
V10
ガラス転移温度(ポリマー, スキャン計算) ポリプロピレン, Dreiding, ポリマーメルト, ポリマービルダ, 比体積, Tg, パラメータ・構造スキャンアドオン NEW 2022年10月18日 アドオンが必要
エコノミー・
学生版非対応

Quantum ESPRESSO

キーワード 更新日 備考
基礎編 シリコン, SCF計算, PBE, バンド構造, 状態密度, 部分状態密度, 電子密度UPDATED 2022年11月4日 動画あり(V10)
構造最適化 ルチル型酸化チタン, 構造最適化, アニメーション 2022年5月9日 -
強磁性体、反強磁性体 鉄, Fe, BCC, 酸化ニッケル, NiO, 岩塩型構造, スピン分極計算, DFT+U, バンド構造, 状態密度, 部分状態密度UPDATED 2022年10月18日 -
DFT+U・平衡電位 コバルト酸リチウム, LiCoO2, リチウムイオン二次電池, 電極, Habbard U, 全エネルギーNEW 2022年10月1日 -
ハイブリッド汎関数 シリコン, HSE06, 混成汎関数, バンドギャップ NEW 2022年10月14日 -
Van der Waals補正 グラファイト, Grimme-D2, GGA, ファンデルワールス力, 分散力 NEW 2022年10月31日 -
フェルミ面 銅, FCC, フェルミ面, FermiSurfer 2022年5月13日 -
表面再構成 Si, 部分構造を固定した構造最適化計算, スラブモデル, (001)面, 非対称ダイマー構造 NEW 2023年1月10日 -
仕事関数 Pt, 構造最適化, スラブモデル, (111)面, 仕事関数, ポテンシャル分布, ESM法 2022年11月11日 -
誘電関数 シリコン, 誘電関数, epsilon.x 2022年5月12日 -
フォノン計算(DFPT法) シリコン, フォノン計算, ph.x, IR, Raman, 誘電率, 振動, フォノンバンド, フォノン状態密度 2022年4月12日 -
フォノン計算(Phonopy) シリコン, フォノン計算, Phonopy, フォノンバンド, フォノン状態密度, 熱特性, パラメータ・構造スキャンアドオン UPDATED 2022年10月1日 アドオンが必要
エコノミー・
学生版非対応
Born-Oppenheimer MD メタン分子, BOMD, アニメーション, エネルギー, 温度制御, 自己拡散係数 2022年5月10日 エコノミー・
学生版非対応
Car-Parrinello MD メタン分子, CPMD, アニメーション, エネルギー, 温度制御 2021年4月1日 エコノミー・
学生版非対応
V10
NEB法 銅, スラブモデル, 表面吸着モデル, 部分構造を固定した構造最適化計算, NEB, 遷移状態, 表面拡散 UPDATED 2022年12月1日 エコノミー・
学生版非対応
ESM法 アルミ, スラブモデル, 結晶ビルダ, constant-N計算, constant-mu計算, フェルミエネルギー 2022年5月9日 エコノミー・
学生版非対応
ESM-RISM法 アルミ, スラブモデル, THF, 溶媒ファイル, VESTA UPDATED 2022年10月3日 エコノミー
非対応
体積弾性率 Si, 自動計算, 体積弾性率, 状態方程式, パラメータ・構造スキャンアドオン NEW 2022年10月1日 アドオンが必要
BoltzTraP Mg2Si, FCC, ゼーベック係数, 電気伝導率, 電子熱伝導率 UPDATED 2022年10月18日 エコノミー・
学生版非対応

OpenMX

キーワード 更新日 備考
基礎編 ダイアモンド, SCF計算, バンド構造, 状態密度, 部分状態密度, 電子密度 2020年3月2日 V10
分子動力学計算 メタン分子, アニメーション, エネルギー, 温度制御 2020年3月2日 V10

FDMNES

キーワード 更新日 備考
XANESスペクトル 銅, FCC, XANESスペクトル UPDATED 2022年11月15日 エコノミー・
学生版非対応

AkaiKKR

キーワード 更新日 備考
基礎編 ニッケル、鉄-ニッケル、固溶体、CPA計算、状態密度、バンド構造 2022年4月15日 -

DCDFTBMD

キーワード 更新日 備考
構造最適化計算 スチレン分子, 構造最適化, アニメーション 2019年5月10日 アドオンが必要
V9
分子動力学計算 水酸化物イオン, ホッピング拡散, グロタス機構, 動径分布関数, 平均二乗変位, 自己拡散係数 2019年6月7日 アドオンが必要
V9

Fragment ER

キーワード 更新日 備考
結合自由エネルギー計算 NAMD, リゾチーム, PDB, タンパク-リガンド系, エネルギー表示法 2020年5月21日 アドオンが必要
V10

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