6.9. メニュー
NWChemに関するメニューです。
NWChemを利用するためには別途NWChemをインストールする必要があります。 NWChemをインストールする方法は インストール に記載しています。
6.9.1. キーワード設定
NWChemの計算条件を設定します。設定後、すぐに計算を実行する場合は Run ボタン、一旦メインウィンドウに戻る場合は OK ボタンを押してください。
Run をクリックしたときの挙動は 実行 を参照してください。
Reset ボタンでデフォルトの状態に戻ります。
- Easy Setup
簡易設定画面を表示します。
- Use MPI
チェックを入れるとMPIを用います。 並列数はチェックボックスの横に入力します。
- Basicタブ
- Title
タイトルを指定します。
- Basis
基底関数系を指定します。 cartesian/sphericalを選択します。 一部原子の例外をExceptionで指定します。
- Task
計算手法(theory)と計算目的(operation)を指定します。
- Charge
電荷を指定します。
- DFT
- Multiplicity
DFTのスピン多重度を指定します。
- Exchange
DFTの交換関数を指定します。
- Correlation
DFTの相関関数を指定します。
- Disp
経験的分散力補正を指定します。
- SCF
- Multiplicity
SCFの多重度を指定します。
- Wave Function
SCFの計算理論を指定します。
- Property
- Mulliken
Mulliken電荷を出力するか選択します。
- Shielding
NMR計算を行うか選択します。
- Dipole
ダイポールモーメントを出力するか選択します。
- NEB/String タブ
TaskのOperationにnebかstringを指定したときに有効になります。
- NBeads
ビーズの数を指定します。
- KBeads
NEBのバネ定数を指定します。
- MaxIter
最適化の最大繰り返し数を指定します。
- StepSize
最適化のステップサイズを指定します。
- NHist
準ニュートン法で使用するヒストリーの数を指定します。
- Freeze1
ZTSで最初のビーズを固定するか設定します。
- FreezeN
ZTSで最後のビーズを固定するか設定します。
- Convergence
収束条件をloose/default/tightから選びます。
- XYZ_Path
初期パスのファイルを指定します。計算のリスタートなどで使用します。
- Print_Shift
指定したステップ毎にパスを出力します。
- EndGeom
最後のビーズの座標を指定します。 Loadボタンでファイルを指定して読み込めます。 Winmostarで読み込めるフォーマットをXYZ形式で読み込みます。 また、Editボタンで編集することができます。
- Advanced タブ
- Memory
メモリ使用量を指定します。
- Set tolguess
initial guessの精度を指定します。
- ECP
ECPのポテンシャルを指定します。
- Geometry
- noautoz
内部座標の変換を行わないように設定します。
- Other Settings
その他の入力要素を記述します。
- Coordinate format
原子座標の形式（CartesianもしくはZ-matrix）を指定します。
- Reset
設定をリセットします。
- Import
設定ファイルを読み込みます。
- Export
設定ファイルを出力します。
6.9.2. キーワード読み込み
既存のNWChemの入力ファイルから、キーワード（計算条件）のみを読み込みます。
6.9.3. 実行
メインウィンドウでNWChemの入力ファイルが開かれている場合は、そのファイルを使ってNWChemを実行します。 開かれていない場合は、NWChemの入力ファイルを保存した上でNWChemを実行します。
NWChemのプログラムパスは、 で変更することができます。
実行に伴い以下のファイルが生成されます。 例として入力ファイルが
water.nwの時のファイル/フォルダ名を併記しています。
種類
説明
water.out計算のログファイルです。
water.movecs計算の詳細情報をまとめたファイルです。
water.batNWChemを実行するためのバッチファイルです。
water_nw_tmp\ジョブは Winmostar Job Manager を通じて実行されます。
6.9.4. ログを表示 (out)
outファイルをテキストエディタで開きます。
6.9.5. アニメーション
6.9.5.1. 構造最適化
outファイルの情報から構造最適化等のアニメーションを作成し表示します。
アニメーション表示の操作方法は Animation表示エリア を参照してください。
6.9.5.2. NEB/String
xyzファイルの情報からNEB, String計算のアニメーションを作成し表示します。
アニメーション表示の操作方法は Animation表示エリア を参照してください。
6.9.6. 結果解析
6.9.6.1. 分子軌道, 電荷
outファイルの情報から分子軌道, 電荷の情報を取得し表示します。
読み込まれた電荷の情報は などを選択することで分子表示エリアに表示することができます。
サブウィンドウの操作方法は Energy Level Diagramウィンドウ , Surface Setupウィンドウ を参照してください。
6.9.6.2. UV-Visスペクトル
outファイルの情報からUV-Visスペクトルを表示します。
サブウィンドウの操作方法は UV-Vis Spectrumウィンドウ を参照してください。
6.9.6.3. NMRスペクトル
outファイルの情報からNMRスペクトルを表示します。
サブウィンドウの操作方法は NMRウィンドウ を参照してください。
6.9.6.4. IR/ラマンスペクトル
outファイルの情報から振動スペクトル（IRまたはラマンスペクトル）を表示します。
RUNTYP=HESSIAN のoutファイルからIRスペクトルを読み込ませた後、続けて本メニューで RUNTYP=RAMAN のoutラマンスペクトルを読み込ませると、両方のスペクトルを同時にサブウィンドウに表示することができます。
サブウィンドウの操作方法は IR Spectrumウィンドウ を参照してください。